[bug] codebase 图谱检索多处缺陷（不递归/camelCase 失效/全局图被覆盖/tokenizer 不一致）

[jeff-r2026]

codebase 图谱检索链路（src/code-knowledge-recall.ts / src/codebase-extract.ts）的若干缺陷，单独成条便于逐个修复：

1. loadWikiPages 不递归，子目录页面检索不到

// src/code-knowledge-recall.ts:217-242
files = await readdir(projectDir); // 只读项目根一层 *.md

而 extract 会在 modules/*.md 生成模块页（src/codebase-extract.ts:618-624），这些页永远进不了检索。
建议：改用 listFilesRecursive / glob **/*.md。

2. camelCase 拆分永久失效

// src/code-knowledge-recall.ts:43-45
const lower = text.toLowerCase();
const camelSplit = lower.replace(/([a-z])([A-Z])/g, '$1_$2').toLowerCase();

先 toLowerCase() 再做 ([a-z])([A-Z]) 替换——小写后已无大写字母，注释写的“B4 fix: camelCase splitting”实际从不执行。getUserName、ApiTimeout 等查询无法被拆词命中。
建议：在 toLowerCase() 之前做 camelCase split。

3. extractCodebase 覆盖全局图谱（多仓互相覆盖）

// src/codebase-extract.ts:573-577
saveGraphIndex(wikiRoot, mergedGraph); // 直接写全局 .indices/graph-index.json，不 merge 已有

单仓 extract 直接覆盖全局 graph-index.json，不合并已有内容；多仓 wiki 会被最后一次 extract 覆盖（只有 graph-aggregate.ts 才做多仓合并）。
建议：extract 只写 per-repo 图，再调 aggregateGlobalGraph；或 save 前先 load + merge。

4. 两套 tokenizer 不一致

learnings 索引用 Intl.Segmenter（保留单字 CJK token，src/utils/search-index.ts:213-253），codebase 用正则 + 仅 bigram（src/code-knowledge-recall.ts:41-57）。同一中文 query 在两侧产生不同 token 集，跨源召回不一致。
建议：抽取共享 tokenize() 供两路复用。

5. loadGraphIndex 对畸形 JSON 不健壮

文件缺失/parse 失败会返回 null（OK），但不校验 nodes/edges 是否为数组（src/wiki-engine/core/graph-index.schema.ts:351-358）；半损坏的 graph-index.json 会让 recall 的 codebase 分支整段进 catch。
建议：load 后做最小 schema guard + 空图 fallback。

严重程度：中。